2023年比較腫瘍学常陸宮賞受賞者
The Awardee of the 2023 Prince Hitachi Prize for Comparative Oncology

Molecular genetic study of carcinogenesis using fish-originated Sleeping Beauty transposon system
魚類由来トランスポゾンシステムを用いたがん発生機構の分子遺伝学的研究

Neal G Copeland
Professor of Practice,
Department of Genetics,
MD Anderson Cancer Center

Neal G Copeland博士
MD アンダーソンがんセンター遺伝学科教授

Andrei Seluanov
Assistant Professor
Department of Biology
University of Rochester

アンドレイ セルアノフ 博士
ロチェスター大学生物学部
生物学准教授

略歴

ニール・コープランド博士は1947年ユタ州ローガンで生まれ、ユタ州ソルトレイクシティで育った。1971年にユタ大学で生物学の理学士号を、1976年にユタ大学で生化学の博士号を取得した。その後、ボストンのハーバード大学医学部に移り、ダナファーバー癌研究所のデイモン・ラニヨン博士研究員として勤務。そこでレトロウイルスの研究を行い、NIH 3T3細胞がネズミや鳥のレトロウイルス(Rous肉腫ウイルスを含む)のDNAによって形質転換されることを最初に示した。 ナンシー・ジェンキンス博士は1950年にインディアナポリスで生まれ、そこで育った。スウィート・ブライアー・カレッジで化学の学士号(1972年)を、インディアナ大学で微生物学の修士号(1974年)と分子細胞生物学の博士号(1977年)を取得。その後、ボストンのハーバード・メディカル・スクールに移り、ダナファーバー癌研究所でアメリカ白血病学会の博士研究員を務めた。そこでレトロウイルスの研究も行い、同じ研究室の博士研究員であった夫で長年の共同研究者であるニール・コープランドと出会った。1980年、ふたりは結婚して夫婦チームを結成し、すべての論文を共同で執筆することにした。コープランドとジェンキンス両博士はジャクソン研究所で最初の独立職を得、その後22年間、国立癌研究所(NCI)フレデリック研究所で上級研究員として過ごし、コープランド博士は哺乳類遺伝学研究所の所長、後にマウス癌遺伝学プログラムの所長を務めた。ジェンキンス博士は発生分子遺伝学部門の責任者であった。2006年、2人はシンガポールの分子細胞生物学研究所に移り、コープランド博士は研究所所長を務め、ジェンキンス博士は遺伝学・ゲノミクス部門の副所長を務めた。2011年に米国に戻り、ヒューストン・メソジスト研究所に加わり、CPRIT奨学生としてがん研究に携わり、がん生物学プログラムを率いた。
コープランドとジェンキンス両博士は、40年以上にわたり、視覚、聴覚、骨格、神経、色素沈着、免疫、造血系に影響を及ぼす疾患など、さまざまなヒトの病気をマウスを使ってモデル化し、研究してきた。癌もまた、彼らの研究室の主要な焦点であった。ジャクソン研究所では、造血器癌に関与する癌遺伝子を同定するために、レトロウイルス挿入突然変異誘発法を採用し始めた。この研究はNCI滞在中も続けられ、彼らはまた、スリーピング・ビューティー(Sleeping Beauty)トランスポーザブル・エレメントが、固形腫瘍を誘発するのに十分な頻度でマウスの体細胞に動員されることを最初に示した。これにより、造血器癌に加えて固形癌のモデルマウスが可能になった。この場合、造血器がん遺伝子のレトロウイルス誘発挿入突然変異誘発ではなく、固形がん遺伝子のSB誘発挿入突然変異誘発によってがんが生じるため、固形がんを生じさせる遺伝子やシグナル伝達経路の同定が容易になった。この技術をフルに活用するため、コープランド博士とジェンキンス博士は、シンガポールとヒューストンの両研究所で、16の異なる臓器・細胞型における癌の発生、進行、転移に関与する遺伝子について、マウスを用いた大規模な前方遺伝学的スクリーニングを行った。これらのスクリーニングで何百ものがん候補遺伝子が同定され、その多くがヒトの腫瘍でも変化していることが証明され、新規がん治療薬開発のための新たな創薬標的の同定に加えて、ヒトのがんがどのように進化するかについての重要な新情報を提供した。2017年、彼らはヒューストン・メソジストの研究室を閉鎖し、MDアンダーソンがんセンターの遺伝学科に移った。
コープランド博士とジェンキンス博士は合わせて850以上の論文を発表し(h-index=161)、数多くの科学諮問委員会や編集委員会の委員を務め、2人とも米国科学アカデミーの会員である。

Personal History Outline

 Dr. Neal Copeland was born in Logan, Utah in 1947 and grew up in Salt Lake City, Utah. He received his BS degree from the University of Utah in Biology in 1971 and his Ph.D. in Biochemistry from the University of Utah in 1976. He then moved to Harvard Medical School in Boston where he was a Damon Runyon postdoctoral fellow at the Dana Farber Cancer Institute. There, he studied retroviruses and was among the first to show that NIH 3T3 cells could be transformed by the DNA of murine and avian retrovirus, including Rous sarcoma virus.  Dr. Nancy Jenkins was born in Indianapolis Indiana in 1950 and grew up there as well. She received her BA degree from Sweet Briar College in Chemistry (1972) and her MA in Microbiology (1974) and PhD in Molecular and Cell Biology (1977) from Indiana University. She then moved to Harvard Medical School in Boston where she was a Leukemia Society of America postdoctoral fellow at the Dana Farber Cancer Institute. There, she also studied retroviruses and met her husband and long-time collaborator, Neal Copeland, who was a postdoctoral fellow in the same laboratory. In 1980, they decided to get married and form a husband-and-wife team and co-author all papers together. Drs. Copeland and Jenkins took their first independent positions at The Jackson Laboratory and then spent 22 years at the National Cancer Institute (NCI)-Frederick as Senior Investigators, where Dr. Copeland served as Director of the Mammalian Genetics Laboratory and later the Mouse Cancer Genetics Program. Dr. Jenkins headed the Molecular Genetics of Development Section. They joined the Institute of Molecular and Cell Biology in Singapore in 2006, where Dr. Copeland served as Institute Director for most of their stay, while Dr. Jenkins served as Deputy Director of the Genetics and Genomics Division. They returned to the United States in 2011 and joined the Houston Methodist Research Institute, where they were CPRIT scholars in Cancer Research and headed the Cancer Biology Program.
For more than 40 years, Drs. Copeland and Jenkins used the mouse to model and study many different human diseases, including disorders affecting the visual, auditory, skeletal, nervous, pigmentation, immune and hematopoietic systems. Cancer has also been a major focus of their laboratory. At the Jackson Laboratory, they began employing retroviral insertional mutagenesis to identify cancer genes contributing to hematopoietic cancer. This work continued during their stay at the NCI, where they were also among the first to show that the Sleeping Beauty transposable element could be mobilized in mouse somatic cells at frequencies high enough to induce solid tumors. This made it possible to model solid tumors in mice in addition to hematopoietic cancers. In this case, cancer results from SB-induced insertional mutagenesis of solid tumor cancer genes rather than retrovirus-induced insertional mutagenesis of hematopoietic cancer genes, facilitating the identification of genes and signaling pathways that give rise to solid tumors. To fully exploit this technology, Drs. Copeland and Jenkins performed massive forward genetic screens in mice for genes involved in the initiation, progression, and metastasis of cancer in 16 different organ/cell types in both their Singapore and Houston laboratories. Hundreds of candidate cancer genes were identified in these screens; and many also proved to be altered in human tumors, providing important new information as to how human cancer evolves, in addition to identifying new drug targets for the development of novel cancer therapeutics. In 2017, they closed their laboratory at Houston Methodist and moved to the Department of Genetics at the MD Anderson Cancer Center where they currently serve as Professors of Practice.
Drs. Copeland and Jenkins have published more than 850 papers together (h-index=161), served on numerous scientific advisory and editorial boards, and are both members of the National Academy of Sciences, USA.

研究業績

がん遺伝子発見のための挿入突然変異誘発法の活用

コープランド博士とジェンキンス博士は、そのキャリアの初期から、がんモデルマウスにおける造血器がん遺伝子の同定にレトロウイルス挿入突然変異誘発法を用いたパイオニアである。 彼らはまた、挿入型突然変異誘発研究にinverse PCR(IPCR)を使用する先駆者でもあり、これにより大規模な造血器がん候補遺伝子の同定が可能になった。これらのスクリーニングで何百ものがん候補遺伝子が同定され、その中にはすでに白血病に関与している経路で機能するものもあれば、新たな疾患経路を定義するものもあった。 これらの研究は、がん遺伝子の発見と機能ゲノミクスのツールとしてのマウスの力を強調した。比較ゲノム研究では、これらの遺伝子の多くが、Evi1、Evi2(Nf1)、Hoxa9、Evi9(Bcl11a)など、ヒトのがん遺伝子としても重要であることが示された。Evi1はレトロウイルスとの統合によって活性化されるジンクフィンガー転写因子である。 これは、この遺伝子ファミリーのメンバーが造血細胞の形質転換に関与していることを示唆した最初の例である。Evi1はヒト骨髄性白血病遺伝子でもあり、遺伝子治療後にX連鎖性慢性肉芽腫患者に誘導されるヒト白血病においてウイルス統合によって活性化される。Evi2はヒトのvon Recklinghausen神経線維腫症(Nf1)疾患遺伝子座と密接に関連している。 Evi2の統合はNf1の大きなイントロンにあり、そこでNf1の発現が不活性化される。 マウスのEvi2遺伝子座は、ヒトで最も変異の多い疾患遺伝子の一つであるヒトNf1遺伝子のクローニングに重要なマーカーとなった。 Nf1の塩基配列決定により、それがRas-Gapであることが示され、その機能に関する重要な情報が得られた。さらに研究を進めると、Nf1の欠損が、Rasを介したGM-CSFに対する過敏症を通じて骨髄増殖性疾患を誘導することが示された。Hoxa9、Hoxa7およびPbx1は、マウス骨髄性白血病において活性化されたがん遺伝子として同定された。 これらの活性化パターンは、これらのホメオボックス遺伝子が白血病誘導に協力していることを示唆した。これは、Pbx1関連遺伝子が白血病形成においてHox遺伝子と協力していることを示す最初の遺伝学的証拠となった。比較研究により、ヒト骨髄性白血病ではHoxa9がNup98と融合していることが示され、ヒト白血病におけるNup98の役割がさらに示唆された。Evi9(Bcl11a)はマウス骨髄性白血病遺伝子の候補として同定された。さらなる研究により、Bcl11aは正常なリンパ球の発生に必須であり、非細胞自律的T細胞腫瘍抑制遺伝子としても機能する可能性が示された。

トランスポゾンは、下等真核生物では機能的ゲノムスクリーニングのための重要な遺伝学的ツールを提供してきたが、高等真核生物では、そのトランスポジション頻度が低いため、あまり有用ではないことが証明されている。 2005年、コープランド博士とジェンキンス博士は、スリーピング・ビューティー(SB)トランスポゾンがマウスの体細胞にがんを誘発するのに十分な頻度で動員できることを示した。これは、造血器がんしか誘発できないレトロウイルス挿入突然変異誘発とは対照的に、事実上あらゆる細胞型でマウスのがんを誘発する方法を提供するものであった。 今、コープランド博士とジェンキンス博士は初めて、挿入突然変異誘発法を用いて、マウスの事実上あらゆるタイプの癌をモデル化することができるようになった。いくつかの例を挙げると、(1)彼らはB型慢性肝炎マウスモデルにおいて、肝細胞癌を引き起こす数百の遺伝子をSB突然変異誘発法によって同定した。 これらの遺伝子はヒトの肝細胞癌で重要な遺伝子に富んでおり、多くは代謝プロセスで機能していた。これらの研究により、肝細胞癌の遺伝的背景を概観することができた。(2) 消化管腫瘍の進行を促進する遺伝子と進化的な力を同定した。(3) Braf(V600E)メラノーマのドライバーを同定した。(4)胃癌発生において変異Smad4と協調する遺伝子の同定。コープランド博士とジェンキンス博士はまた、SBCapSeqと呼ばれる新技術を開発し、単一腫瘍細胞からSB挿入部位のクローニングと配列決定を可能にした。 これにより、腫瘍の発生と進行に関与する遺伝子を、協力的な癌遺伝子と同様に決定的に同定することができるようになった。また、in vivo機能喪失スクリーニングを用いて、KPNB1を上皮性卵巣癌における新たな治療可能な癌遺伝子として同定した。最後に、彼らはヒト結腸癌転移の初期段階に関与する癌ドライバー遺伝子を同定できる再細胞化ヒト結腸モデルを開発した。
コープランド博士とジェンキンス博士の研究は、癌がどのように進化するかについての新しい考え方も提供した。 アーニー・レヴィン博士との共同研究で、彼らは、腫瘍形成につながる最初の突然変異は、腫瘍細胞の生存を高めるだけでなく、腫瘍の進行に寄与する二次的な突然変異を選択し、これらの突然変異はしばしば組織優先的に作用することを提唱した。 彼らのモデルは、遺伝性の突然変異が、同じ遺伝子の自然突然変異と比較して、しばしば異なる組織特異性を持つ理由を説明している。言い換えれば、がん遺伝子の突然変異はランダムに起こるが、ランダムに選択されるわけではない。 最初に発生した突然変異が、次に発生する突然変異の選択に影響を及ぼし、さらにその下へと続いていくのである。 言い換えれば、腫瘍形成には変異の順番と細胞のタイプが重要なのである。ある特定の細胞タイプにおいて、ある突然変異がなぜ第二の突然変異を選択するのかを理解することは、いつか遺伝子標的併用療法の設計に役立つかもしれない。

Academic Achievement

Harnessing Insertional Mutagenesis for Cancer Gene Discovery

Beginning early in their careers Drs. Copeland and Jenkins pioneered the use of retroviral insertional mutagenesis for identifying hematopoetic cancer genes in mouse models of cancer.  They also pioneered the use of inverse PCR (IPCR) for insertional mutagenesis studies, which made it possible to identify candidate hematopoetic cancer genes on a large scale. Hundreds of candidate cancer genes were identified in these screens, some of which functioned in pathways already implicated in leukemia, whereas others defined new disease pathways.  These studies underscored the power of the mouse as a tool for cancer gene discovery and functional genomics. Comparative genomic studies showed that many of these genes were also important human cancer genes such as Evi1, Evi2 (Nf1), Hoxa9 and Evi9 (Bcl11a). Evi1 is a zinc finger transcription factor that is activated by retroviral integration.  This was the first implication for a member of this gene family in the transformation of hematopoetic cells. Evi1 is also a human myeloid leukemia gene that is activated by viral integration in human leukemias induced in X-linked chronic granulomatous patients following gene therapy. Evi2 is tightly linked to the von Recklinghausen neurofibromatosis (Nf1) disease locus in humans.  Evi2 integrations are in a large intron of Nf1 where they inactivate its expression.  The mouse Evi2 locus provided a critical marker for cloning of the human Nf1 gene, which is one of the most highly mutated disease genes in humans.  Sequencing of Nf1 showed that it is a Ras-Gap, providing critical information about its function. Further studies showed that Nf1 loss induces myeloproliferative disease through a Ras-medicated hypersensitivity to GM-CSF. Hoxa9, Hoxa7 and Pbx1 were identified as activated oncogenes in mouse myeloid leukemia.  Their pattern of activation implied that these homeobox genes cooperate in leukemia induction. This provided the first genetic evidence that Pbx1-related genes cooperate with Hox genes in leukemia formation. Comparative studies showed that Hoxa9 is fused to Nup98 in human myeloid leukemia, further suggesting a role for Nup98 in human leukemia. Evi9 (Bcl11a) was identified as a candidate mouse myeloid leukemia gene. Further studies showed that Bcl11a is essential for normal lymphoid development and may also function as a non-cell-autonomous T cell tumor suppressor gene.
Transposons have provided important genetic tools for functional genomic screens in lower eukaryotes but have proven less useful in higher eukaryotes because of their low transposition frequency.  In 2005, Drs. Copeland and Jenkins showed that the Sleeping Beauty (SB) transposon could be mobilized in mouse somatic cells at frequencies high enough to induce cancer. This provided a way to induce cancer in mice in virtually any cell type, as opposed to retroviral insertional mutagenesis, which could only induce hematopoietic cancer.  Now, for the first time, Drs. Copeland and Jenkins could use insertional mutagenesis to model virtual any type of cancer in the mouse. In some examples, (1) they used SB mutagenesis to identify hundreds of genes driving hepatocellular carcinoma in a chronic hepatitis B mouse model.  These genes were enriched in genes important in human HCC and many functioned in metabolic processes. These studies provided an overview of the genetic landscape of HCC. (2) Identified genes and evolutionary forces driving gastrointestinal tract tumor progression. (3) Identified drivers of Braf(V600E) melanoma. (4) Identified genes that cooperate with mutant Smad4 in gastric cancer development. Drs. Copeland and Jenkins also developed a new technology called SBCapSeq that made it possible to clone and sequence SB insertion sites from single tumor cells.  Genes involved in tumor initiation and progression could now be identified conclusively as could cooperating cancer genes. They also used in vivo loss-of-function screens to identify KPNB1 as a new druggable oncogene in epithelial ovarian cancer. Finally, they developed a recellularized human colon model that could identify cancer driver genes involved in early stages of human colon cancer metastasis. 
Drs. Copeland and Jenkins studies also provided a new way of thinking about how cancer evolves.  In studies done in collaboration with Dr. Arnie Levine, they proposed that the initial mutations that lead to tumor formation not only enhance the survival of the initiating tumor cell but also select for secondary mutations that contribute to tumor progression and that these mutations often act in a tissue-preferred fashion.  Their model explains why inherited mutations often have different tissue specificities compared to spontaneous mutations in the same gene. In other words, while mutations in cancer genes occur randomly, they are not selected randomly.  The mutation that occurs first affects the selection of mutations that occur next, and so on down the line.  In other words, the order of mutations and cell type matters in tumor formation. Understanding why one mutation selects for a second mutation in a particular cell type could one day aid in the design of gene-targeted combination therapies.

Bibliography (Selected):

Mucenski, M.L., Taylor, B.A., Ihle, J.N., Hartley, J.W., Morse, H.C., III, Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  1988.  Identification of a common ecotropic viral integration site, Evi-1, in the DNA of AKXD murine myeloid tumors.  Mol. Cell. Biol. 8, 301-308.

Morishita, K., Parker, D.S., Mucenski, M.L., Jenkins, N.A., Copeland, N.G., and Ihle, J.N.  1988.  Retroviral activation of a novel gene encoding a zinc finger protein in IL-3-dependent myeloid leukemia cell lines.  Cell 54, 831-840.

Viskochil, D., Buchberg, A.M., Xu, G., Cawthon, R.M., Stevens, J., Wolff, R.K., Culver, M., Carey, J.C., Copeland, N.G., Jenkins, N.A., White, R., and O'Connell, P.  1990.  Deletions and a translocation interrupt a cloned gene at the neurofibromatosis type 1 locus.  Cell 62, 187-192.

Buchberg, A.M., Bedigian, H.G., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  1990.  Evi-2, a common integration site involved in murine myeloid leukemogenesis.  Mol. Cell. Biol. 10, 4658-4666.

Buchberg, A.M., Cleveland, L.S., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  1990.  Sequence homology shared by neurofibromatosis type-1 gene and IRA-1 and IRA-2 negative regulators of the RAS cyclic AMP pathway.  Nature 347, 291-294.

Largaespada, D.A., Brannan, C.I., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  1996.  Nf1 deficiency causes Ras-mediated granulocyte-macrophage colony stimulating factor hypersensitivity and chronic myeloid leukemia.  Nat. Genet. 12, 137-143.

Nakamura, T., Largaespada, D.A., Shaughnessy, J.D., Jr., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  1996.  Cooperative activation of Hoxa and Pbx1-related genes in murine myeloid leukemias.  Nat. Genet. 12, 149-153.

Nakamura, T., Largaespada, D.A., Lee, M.P., Johnson, L.A., Ohyashiki, K., Toyama, K., Chen, S.J., Willman, C.L., Chen, I.-M., Feinberg, A.P., Jenkins, N.A., Copeland, N.G., and Shaughnessy, Jr., J.D.  1996.  Fusion of the nucleoporin gene NUP98 to HOXA9 by the chromosome translocation t(7;11) (p15;p15) in human myeloid leukemia.  Nature Genetics 12, 154-158. 

Li, J., Shen, H., Himmel, K.L., Dupuy, A.J., Largaespada, D.A., Nakamura, T., Shaughnessy, J.D., Jr., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  1999.  Leukemia disease genes:  Large-scale cloning and pathway predictions.  Nature Genet. 23, 348-353.

Suzuki, T., Shen, H., Akagi, K., Morse III, H.C., Malley, J.D., Naiman, D.Q., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  2002.  Retroviral tagging provides a potent cancer gene discovery tool in the post-genome-sequence era.  Nature Genet. 32, 166-174.

Liu, P., Keller, J.R., Ortiz, M., Tessarollo, L., Nakamura, T., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G., 2003.  Bcl11a is essential for normal lymphoid development.  Nature Immunol. 4, 525-531.

Davé, U., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G.  2004.  Gene therapy insertional mutagenesis insights.  Science.  303, 333.

Dupuy, A. J., Akagi, K., Largaespada, D.A., Copeland, N.G., and Jenkins, N.A.  2005.  Mammalian mutagenesis using a highly mobile somatic Sleeping Beauty transposon system.  Nature. 436, 221-226.

Ott, M.G.,  Schmidt,  M., Schwarzwaelder,  K., Stein, S.,  Siler,  U.,  Koehl,  U.,  Glimm,  H., Kuhlcke,  K.,  Schilz,  A.,  Kunkel,  H.,  Naundorf,  S.,  Brinkmann,  A.,  Deichmann,  A., Fischer,  M.,  Ball,  C.,  Pilz,  I.,  Dunbar,  C.,  Du, Y.,  Jenkins,  N.A.,  Copeland,  N.G.,  Luthi,  U.,  Hassan,  M.,  Thrasher,  A.J.,  Hoelzer,  D., von Kalle,  C.,  Seger,  R.,  Grez,  M.  2006.  Correction of X-linked chronic granulomatous disease by gene therapy, augmented by insertional activation of MDS-EVI1, PRDM16, or SETBP1.  Nat. Med., 12, 401-409.

Bard-Chapeau, E.A., Nguyen, A.T., Rust, A.G., Sayadi, A., Lee, P., Chua, B.Q., New, L.S., de Jong, J., Ward, J.M., Chin, C.K., Chew, V., Toh, H.C., Abastado, J.P., Benoukraf, T., Soong, R., Bard, F.A., Dupuy, A.J., Johnson, R.L., Radda, G.K., Chan, E.C., Wessels, L.F., Adams, D.J., Jenkins, N.A., and Copeland, N.G. 2014. Transposon mutagenesis identifies genes driving hepatocellular carcinoma in a chronic hepatitis B mouse model. Nature Genet., 46, 24-32.

Takeda, H., Wei, Z., Koso, H., Rust, A.G., Yew, C.C.K., Mann, M.B., Ward, J.M., Adams, D.J., Copeland, N.G., and Jenkins, N.A. 2015. Transposon mutagenesis identifies genes and evolutionary forces driving gastrointestinal tract tumor progression. Nature Genet. 47, 142-150.

Mann, M.B., Black, M.A., Jones, D.J., Ward, J.M., Yew, C.C.K., Newberg, J.Y., Dupuy, A.J., Rust, A.G., Bosenberg, M.W., McMahon, M, Print, C.G., Adams, D.J., Copeland, N.G., and Jenkins, N.A. 2015. Transposon mutagenesis uncovers evolutionary forces driving BrafV600E melanoma. Nature Genet. 47, 486-495.

Takeda, H., Rust, A.G., Ward, J.M., Yew, C.C., Jenkins, N.A. and Copeland, N.G. 2016. Sleeping Beauty transposon mutagenesis identifies genes that cooperate with mutant Smad4 in gastric cancer development. Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 113, E2057-2065.

Kodama, T., Bard-Chapeau, E.A., Newberg, J.Y., Kodama, M., Rangel, R., Yoshihara, K., Ward, J.M., Jenkins, N.A. and Copeland. 2016. Two-step forward genetic screen in mice identifies the Ral GTPase-activating proteins as suppressors of hepatocellular carcinoma. Gastroenterology, 151, 324-337.

Chen, H.J., Wei, Z., Sun, J., Bhattacharya, A., Savage, D.J., Serda, R., Mackeyev, Y., Curley, S.A., Bu., P., Wang, L., Chen, S., Cohen-Gould, L., Huang, E., Shen, X., Lipkin, S.M., Copeland, N.G., Jenkins, N.A. and Shuler, M.L. 2016. A recellularized human colon model identifies cancer driver genes. Nature Biotechnology, 34, 845-851.

Mann, K.M., Newberg, J.Y., Black, M.A., Jones, D.J., Amaya-Manzanares, F., Guzman-Rojas, L., Kodama, T., Ward, J.M., Rust, A.G., van der Weyden, L., Yew, C.C., Waters, J.L., Leung, M.L., Rogers, K., Rogers, S.M., McNoe, L.A., Selvanesan, L., Navin, N., Jenkins, N.A., Copeland, N.G. and Mann, M.B. 2016. Analyzing tumor heterogeneity and driver genes in single myeloid leukemia cells with SBCapSeq. Nature Biotechnology, 34, 962-972.

Kodama, M., Newberg, J.Y., Katayama, H., Kobayashi, M., Hanash, S.M., Yoshihara, K., Wei, Z., Tien, J.C., Rangel, R., Hashimoto, K., Mabuchi, S., Sawada, K., Kimura, T., Copeland, N.G., Kodama, T., and Jenkins N.A. 2017. In vivo loss-of function screens identify KPNB1 as a new druggable oncogene in epithelial ovarian cancer. Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 114, E7301-E7310.

Levine, A.J., Jenkins, N.A. and Copeland, N.G. 2019. The roles of initiating truncal mutations in human cancers: the order of mutations and tumor cell type matters. Cancer Cell, 35, 10-15.