部門紹介

印刷

  • HOME
  • 部門紹介
  • リキッドバイオプシー診断開発プロジェクト

リキッドバイオプシー診断開発プロジェクト

最終更新日 : 2022年11月10日

部の紹介

リキッドバイオプシーシステム開発グループ

画像

画像 体液中に存在するバイオマーカーを用いて腫瘍のゲノムプロファイリングを行うリキッドバイオプシーは診断・治療戦略の観点からがん診療分野で非常に注目されています。リキッドバイオプシーの利点として、1) 従来のバイオプシーと異なり腫瘍組織の直接採取が不要であるため、非常に低侵襲であること、2) 血液・尿などを用いることからサンプル採取が容易かつ繰り返し行うことができることが挙げられます。また、がん治療期間中にリキッドバイオプシーを用いた経時的なモニタリングを行うことで体内の腫瘍動態をリアルタイムで把握できることから、画像診断で不可能な微小残存腫瘍の検出、治療反応性・抵抗性の評価や再発の早期発見が可能です。私たちのグループでは腫瘍細胞から血液中に放出されたDNA断片である腫瘍由来循環DNA（ctDNA）に着目し、これらのDNA断片を用いて腫瘍の分子プロファイリングを行っています。

研究内容

私たちのグループでは主に血液サンプルを次世代シーケンサーに使用してさまざまなトランスレーショナル研究を臨床医と密接に連携しながら実施しています。 以下にグループの目的をお示しします。

  1. がん診療におけるリキッドバイオプシーの臨床的有用性の評価
    1. さまざまな固形癌のctDNA検出
    2. 固形癌の微小残存病変の評価
    3. 抗がん剤治療の効果判定/薬物耐性のモニタリング
    4. 腫瘍の進行および再発の早期検出
    5. 標的治療のためのゲノムプロファイリング
  2. マルチオミクス解析によるctDNAの特性解明
    1. フラグノミクス解析
    2. エピジェネティクス解析
  3. 血液以外のリキッドバイオプシーの ctDNA 解析

代表論文

  1. Watanabe K, Nakamura T, Kimura Y, Motoya M, Kojima S, Kuraya T, Murakami T, Kaneko T, Shinohara Y, Kitayama Y, Fukuda K, Hatanaka KC, Mitsuhashi T, Pittella-Silva F, Yamaguchi T, Hirano S, Nakamura Y, Low SK.
    Tumor-Informed Approach Improved ctDNA Detection Rate in Resected Pancreatic Cancer.
    Int J Mol Sci. 2022 Sep 29;23(19):11521.
  2. Chan HT, Chin YM, Low SK.
    Circulating Tumor DNA-Based Genomic Profiling Assays in Adult Solid Tumors for Precision Oncology: Recent Advancements and Future Challenges.
    Cancers (Basel). 2022 Jul 4;14(13):3275.
  3. Low SK, Ariyasu R, Uchibori K, Hayashi R, Chan HT, Chin YM, Akita T, Harutani Y, Kiritani A, Tsugitomi R, Manabe R, Ogusu S, Amino Y, Kitazono S, Yanagitani N, Nakamura Y, Nishio M.
    Rapid genomic profiling of circulating tumor DNA in non-small cell lung cancer using Oncomine Precision Assay with Genexus™ integrated sequencer.
    Transl Lung Cancer Res. 2022 May;11(5):711-721.
  4. Chin YM, Shibayama T, Chan HT, Otaki M, Hara F, Kobayashi T, Kobayashi K, Hosonaga M, Fukada I, Inagaki L, Ono M, Ito Y, Takahashi S, Ohno S, Ueno T, Nakamura Y, Low SK.
    Serial circulating tumor DNA monitoring of CDK4/6 inhibitors response in metastatic breast cancer.
    Cancer Sci. 2022 May;113(5):1808-1820.
  5. Nagayama S, Low SK, Kiyotani K, Nakamura Y.
    Precision Medicine for Colorectal Cancer with Liquid Biopsy and Immunotherapy.
    Cancers (Basel). 2021 Sep 25;13(19):4803.
  6. Pittella-Silva F, Kimura Y, Low SK, Nakamura Y, Motoya M.
    Amplification of mutant KRASG12D in a patient with advanced metastatic pancreatic adenocarcinoma detected by liquid biopsy: A case report.
    Mol Clin Oncol. 2021 Sep;15(3):172.
  7. Watanabe K, Nakamura Y, Low SK.
    Clinical implementation and current advancement of blood liquid biopsy in cancer.
    J Hum Genet. 2021 Sep;66(9):909-926.
  8. Chin YM, Takahashi Y, Chan HT, Otaki M, Fujishima M, Shibayama T, Miki Y, Ueno T, Nakamura Y, Low SK.
    Ultradeep targeted sequencing of circulating tumor DNA in plasma of early and advanced breast cancer.
    Cancer Sci. 2021 Jan;112(1):454-464.
  9. Chan HT, Chin YM, Nakamura Y, Low SK.
    Clonal Hematopoiesis in Liquid Biopsy: From Biological Noise to Valuable Clinical Implications.
    Cancers (Basel). 2020 Aug 14;12(8):2277.
  10. Ishigaki K, Akiyama M, Kanai M, Takahashi A, Kawakami E, Sugishita H, Sakaue S, Matoba N, Low SK, Okada Y, Terao C, Amariuta T, Gazal S, Kochi Y, Horikoshi M, Suzuki K, Ito K, Koyama S, Ozaki K, Niida S, Sakata Y, Sakata Y, Kohno T, Shiraishi K, Momozawa Y, Hirata M, Matsuda K, Ikeda M, Iwata N, Ikegawa S, Kou I, Tanaka T, Nakagawa H, Suzuki A, Hirota T, Tamari M, Chayama K, Miki D, Mori M, Nagayama S, Daigo Y, Miki Y, Katagiri T, Ogawa O, Obara W, Ito H, Yoshida T, Imoto I, Takahashi T, Tanikawa C, Suzuki T, Sinozaki N, Minami S, Yamaguchi H, Asai S, Takahashi Y, Yamaji K, Takahashi K, Fujioka T, Takata R, Yanai H, Masumoto A, Koretsune Y, Kutsumi H, Higashiyama M, Murayama S, Minegishi N, Suzuki K, Tanno K, Shimizu A, Yamaji T, Iwasaki M, Sawada N, Uemura H, Tanaka K, Naito M, Sasaki M, Wakai K, Tsugane S, Yamamoto M, Yamamoto K, Murakami Y, Nakamura Y, Raychaudhuri S, Inazawa J, Yamauchi T, Kadowaki T, Kubo M, Kamatani Y.
    Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases.
    Nat Genet. 2020 Jul;52(7):669-679.
  11. Pittella-Silva F, Chin YM, Chan HT, Nagayama S, Miyauchi E, Low SK, Nakamura Y.
    Plasma or Serum: Which Is Preferable for Mutation Detection in Liquid Biopsy?
    Clin Chem. 2020 Jul 1;66(7):946-957.
  12. Chan HT, Nagayama S, Chin YM, Otaki M, Hayashi R, Kiyotani K, Fukunaga Y, Ueno M, Nakamura Y, Low SK.
    Clinical significance of clonal hematopoiesis in the interpretation of blood liquid biopsy.
    Mol Oncol. 2020 Aug;14(8):1719-1730.
  13. Shibayama T, Low SK, Ono M, Kobayashi T, Kobayashi K, Fukada I, Ito Y, Ueno T, Ohno S, Nakamura Y, Takahashi S.
    Clinical significance of gene mutation in ctDNA analysis for hormone receptor-positive metastatic breast cancer.
    Breast Cancer Res Treat. 2020 Apr;180(2):331-341.
  14. Low SK, Chin YM, Ito H, Matsuo K, Tanikawa C, Matsuda K, Saito H, Sakurai-Yageta M, Nakaya N, Shimizu A, Nishizuka SS, Yamaji T, Sawada N, Iwasaki M, Tsugane S, Takezaki T, Suzuki S, Naito M, Wakai K, Kamatani Y, Momozawa Y, Murakami Y, Inazawa J, Nakamura Y, Kubo M, Katagiri T, Miki Y.
    Identification of two novel breast cancer loci through large-scale genome-wide association study in the Japanese population.
    Sci Rep. 2019 Nov 22;9(1):17332.
  15. Low SK, Nakamura Y.
    The road map of cancer precision medicine with the innovation of advanced cancer detection technology and personalized immunotherapy.
    Jpn J Clin Oncol. 2019 Jul 1;49(7):596-603.

連絡先

Siew-Kee Amanda Low（グループリーダー）
〒135-8550　江東区有明3-8-31
公益財団法人がん研究会　がんプレシジョン医療研究センター　
リキッドバイオプシー診断開発プロジェクト
リキッドバイオプシーシステム開発グループ
Tel：+81-3-3520-0111 (内線 5625)
Fax：03-3570-0644
E-mail：siewkee.low@jfcr.or.jp

このページのTOPへ