【ニュースリリース】乳がんにおけるシス制御領域の多様性を単一細胞レベルで解明
〜がんの不均一性を理解するための基盤データリソースを構築〜

  • 乳がんの治療反応性や予後に大きなばらつきが見られる「臨床病理学的多様性」は、背景には遺伝子発現を制御するシス制御エレメント(CREs)の多様性が存在すると考えられていますが、がん組織の複雑な細胞構成と不均一性のため、これまでCREの網羅的な理解は困難でした。
  • 本研究では高精度なクロマチンアクセシビリティ情報を取得し、網羅的な解析の結果、乳がん組織内のがん細胞や免疫・間質細胞において224,585個のCREを特定し、乳がん全体のシス制御ネットワークを構築しました。このネットワーク解析により、がんの多様性がCREレベルで規定されていることを初めて明確に示しました。
  • 本研究は、乳がんのエピゲノム制御構造(DNAの塩基配列を変えずに遺伝子の働きを制御する仕組み)を単一細胞レベルで包括的に解析した大規模研究であり、がんの不均一性を理解するための基盤データリソースとして今後の研究に大きく貢献することが期待されます。将来的には、CREの異常を標的とする個別化エピゲノム治療の開発にもつながる可能性があります。

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乳がんにおけるシス制御領域の多様性を単一細胞レベルで解明

最近の論文

  • Bernardi, F., Torrejon, J., Basili, I., Van Ommeren, R., Marsaud, V., Yu, H., Talbot, J., Souphron, J., Indersie, E., Forget, A., Bonneau, B., Massiot, A., Alcazar, C., Figeac, L., Bonerandi, E., Cancila, G., Sirbu, O., Yadav, N., Mohanakrishnan, D., Lombard, B., Loew, D., Poullet, P., Liva, S., Lovino, M., Lin, I. H., Nakashima, T., Gharsalli, T., Nicolas, P. A., Yubuki, N., Ribas, R. A., Colsch, B., Chu-Van, E., Castelli, F., Sampaio, J. L., Leboucher, S., Lasgi, C., Besse, L., Soler, M. N., Lo Re, V., Planque, N., Abeysundara, N., Balin, P., Wang, H., Su, H., Wu, X., Cavalli, F. M. G., Saulnier, O., Ficarra, E., Di Marcotullio, L., Kumegawa, K., Maruyama, R., Kawauchi, D., Picard, D., Remke, M., Riffaud, L., Puiseux, C., Bouchoucha, Y., Huybrechts, S., Simbozel, M., Bourdeaut, F., Varlet, P., Puget, S., Blauwblomme, T., Andrianteranagna, M., Planchon, J. M., Dugourd, A., Saez-Rodriguez, J., Barillot, E., Servant, N., Martignetti, L., Rich, J., Kool, M., Pfister, S. M., Agnihotri, S., Suzuki, H., Fanjul, M., Wang, W. J., Tsai, J. W., Sun, R. C., Beccaria, K., Dufour, C., Sarry, J. E., Michealraj, K. A., Taylor, M. D. and Ayrault, O.
    Multiomic integration reveals tumoral heterogeneity of lipid dependence within lethal group 3 medulloblastoma.
    Cancer Cell, 44, 383-404.e18 (2026)
  • Miyatake, Y., Kamakura, T., Ikawa, T., Yanagiya, R., Kotaki, R., Kameda, K., Nasu, R. K., Okuyama, K., Hirano, K. I., Hosokawa, H., Hozumi, K., Ohtsuka, M., Kisikawa, T., Shibata, C., Otsuka, M., Maruyama, R., Ando, K., Kurosaki, T., Kawamoto, H. and Kotani, A.
    A single microRNA miR-195 rescues the arrested B cell development induced by EBF1 deficiency.
    eLife, 13, RP101510 (2026)
  • Furukawa, T., Kumegawa, K., Miyata, K., Takamatsu, M., Iesato, A., Saeki, S., Yang, L., Shibata, C., Takahara, T., Masuda, K., Mie, T., Okamoto, T., Takeda, T., Sasaki, T., Ozaka, M., Tanaka, M., Takahashi, S., Noda, T., Yao, R., Sasahira, N. and Maruyama, R.
    Patient-derived orthotopic xenograft models recapitulate the peritoneal dissemination of pancreatic cancer and delineate its transcriptional and regulatory programs.
    J. Exp. Clin. Cancer Res., in press (2026)
  • Nakayama, C., Fang, Q., Daigaku, Y., Aoi, Y., Ito, S., Takahashi, M., Shimatani, R., Minamisawa, T., Ozturk, Y., Kimura, H., Shilatifard, A., Tellier, M. and Nojima, T.
    NELF prevents transcriptional readthrough into DNA replication zones in cancer cells.
    EMBO Rep., in press (2026)
  • Tanaka, Y., Sakahara, M., Yamanaka, H., Natsume, Y., Kusama, D., Kumegawa, K., Yoshikawa, H., Abe, Y., Okabayashi, K., Matui, S., Kitagawa, Y., Koshikawa, N., Osumi, H., Shinozaki, E., Nagayama, S., Adachi, J., Maruyama, R. and Yao, R.
    Ribosome biogenesis as a potential therapeutic target in KRAS mutant colorectal cancer.
    Nat. Commun., 17, 1224 (2026)

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