本部長
太田　隆博

• 総務部
• 企画部
• 財務部
• 人事部
• 調達部
• 情報システム部
• 広報部

本部長
門田　守人

病院事務部門

• 医事部
• 医療戦略部
• 健診センター管理部

がん研　有明病院

病院長
門田　守人

専門診療部門

• 呼吸器センター
  • 呼吸器内科
  • 呼吸器外科
• 消化器センター
  • 消化器内科
  • 消化器外科
• 乳腺センター
  • 乳腺外科
  • 乳腺内科
• 婦人科
• 頭頸科
• 整形外科
• 泌尿器科（前立腺センターを含む）
• 血液腫瘍科
• 総合腫瘍科
• サルコーマセンター
• 免疫・遺伝子治療科
• 緩和治療科

一般診療部門

• 総合内科
• 麻酔科(ペインクリニック)
• 腫瘍精神科
• 形成外科
• 眼科
• 感染症科
• 皮膚科
• 漢方サポート科
• 歯科

中央診療部門

• 放射線治療部
• 画像診断センター
  • 画像診断部
  • 核医学部
• 内視鏡診療部
• 化学療法部
• 遺伝子診療部
• 中央手術部
• 集中治療部
• 救急部
• リハビリテーション部
• 臨床検査センター
  • 臨床検査部
  • 生理検査部
  • 超音波検査部
  • 遺伝子診断部
• 輸血部
• 臨床病理センター
  • 病理部
  • 細胞診断部
• 栄養管理部

看護部門

• 看護部

薬剤部門

• 薬剤部

医療クオリティマネジメント部門

• 医療クオリティマネジメントセンター
  • 医療安全管理部
  • 院内感染対策部
  • クオリティインプルーブメント部
• 診療情報管理室
• 患者支援センター

臨床教育・研究部門

• 臨床教育研修センター
• 臨床試験・研究センター
  • 臨床試験部
  • 臨床研究部
• 細胞検査士養成所

健診センター

本部長
野田　哲生

• 研究管理部

がん研究所

所長
野田　哲生

• 病理部
• 実験病理部
• 細胞生物部
• がん生物部
• 生化学部
• 物理部
• 遺伝子診断研究部
• 発がん研究部
• エピジェネシス発がん研究部
• 蛋白創製研究部
• 化学療法部
• がんゲノム研究部
• 交流センター
• 図書室
• 動物室

がん化学療法センター

所長
吉田　光昭

• 基礎研究部
• 分子薬理部
• 分子生物治療研究部
• 遺伝子治療研究室
• ゲノム研究部
• 臨床部
• 制癌剤情報室

ゲノムセンター

所長（兼）
野田　哲生

• 新機能抗体創製プロジェクト
• 次世代がん医療開発プロジェクト
• がんオーダーメイド医療開発プロジェクト