牛嶋大

所属

経歴

1995年3月　東京大学工学部計数工学科卒業
1997年3月　東京大学大学院工学系研究科計数工学専攻修士課程修了
2000年3月　同博士課程満期退学
2000年4月　東京理科大学理工学部経営工学科助手
2002年4月　現職

研究分野

・バイオインフォマティクス
・生物統計学

所属学会・研究会

・応用統計学会
・日本計算機統計学会
・日本計量生物学会
・日本統計学会
・日本品質管理学会
・日本癌学会

研究テーマ

質量顕微鏡法を用いた質量分析イメージングデータの解析法および解析ソフトウェアの開発
JST先端計測分析技術・機器開発事業「質量顕微鏡法における空間特異的情報検出ソフトウェアの開発」プロジェクトにおいて、質量分析イメージングデータにおけるピーク抽出法や細胞特異的なピークを辺出する方法の開発、またそれらを自動的に解析・表示を行うソフトウェアの開発を行っている。

遺伝子発現データを用いたがん患者のサブタイプ分類および診断への応用
 マイクロアレイデータを用いてがん患者の分類・判別を行う教師なし･教師あり学習法の開発、分類に関連する機能の探索を行っている。

遺伝子発現データと化合物情報を用いた表現形と関連する化合物モジュールの探索
Connectivity mapなどのデータベースを利用して薬剤感受性を規定する化合物モジュールの探索を行い、その情報を用いて薬剤感受性の予測精度の向上を目指す。

ゲノムワイドSNPデータを用いた遺伝子間相互作用の検出
SNPアレイデータから薬剤副作用と関連する遺伝子間相互作用（SNPの組み合わせ）を網羅的かつ高速に探索する方法を開発する。高速に探索するためのプログラム開発も行う。

ゲノムシーケンスデータを用いたがん特異的な遺伝子変異の検出
次世代ゲノムシーケンサから得られたがん細胞と正常細胞のゲノム配列を比較し、がん特異的な遺伝子変異を検出するための方法論の開発を行う。